色彩
依據圖像的顏色可分為黑白圖像與彩色圖像，后者又可再分為偽彩色圖像與真彩色圖像。黑白圖像沒有色彩信息，偽彩色圖像僅僅是根據灰度值人為地設定為不同的顏色，以便于進一步分析。真彩色圖像是由圖像采集裝置將每一像素的真實色彩分解為紅、綠、藍三種原色信號，每種原色信號又有其灰度等級，zui終再通過計算機重新編碼還原為彩色圖像。所以，真彩色圖像所包含的信息量多于前兩者。細胞
光密度
光密度又稱吸光度，是指光線通過某一物質前與通過后光強度(Io 與Ib )比值的對數值，即log(Io ／Ib )。光密度值與物質含量成正比關系，光密度值越小，說明光線被吸收的程度越小，物質含量則越低。
長度
對于形狀不規則的線形組織結構，一般方法很難計算出長度，如組織中的毛細血管和神經纖維，細胞超微結構中的各種膜性結構等，以往常用排列稀疏或密集等詞描述，圖像分析儀則可測出各種圖像周界線的長度。例如：在活檢組織的子宮頸上皮細胞電子顯微鏡照片上，測出一定范圍內的細胞膜長度為8128像素，橋粒長度為1229像素，計算出橋粒長度占細胞膜總長度的15％，用此方法觀察到癌細胞的橋粒值遠小于正常細胞，因此，則可以提出癌細胞轉移的原因之一可能與癌細胞之間的細胞連接減少有關。
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